ANÁLISE DE DADOS DE TRANSCRIPTÔMICA COM FOCO EM INFLAMAÇÃO SOB EFEITO DE DIETA CETOGÊNICA
A Dieta Cetogênica (KD) tem sido utilizada para perda de peso por simular um estado
de jejum prolongado e para tratamento de epilepsia devido ao fato do jejum demonstrar
propriedades anticonvulsivantes. Evidências demonstram que a dieta também pode auxiliar
na redução da inflamação e aumento da longevidade, porém os mecanismos moleculares
e genéticos não estão bem compreendidos. Por esse motivo, a presente pesquisa buscou
investigar os efeitos da KD em fígados de camundongos usando conjuntos de expressão
gênicos públicos, sendo 3 conjuntos de microarranjos e 3 conjuntos de RNA-Seq. Após a
obtenção dos genes diferencialmente expressos, os mesmos foram submetidos ao plugin
Bingo, para análise de processos biológicos usando Gene Ontology e ao gProfiler, para
análise das vias metabólicas enriquecidas do KEGG. Ambas as analises utilizaram um teste
hipergeométrico com a correção do p-valor pela Razão de Falsas Descobertas de Benjamini
e Hochberg (FDR) menor que 0,05. Um dos conjuntos da análise de RNA-Seq não gerou
genes diferencialmente expressos e por esse motivo foi excluído das análises subsequentes.
A fim de verificar achados consistentes, a intersecção entre os dados foi realizada, porém
nenhum gene diferencialmente expresso foi obtido na intersecção entre todos os conjuntos e
por esse motivo foi realizada a união dos genes diferencialmente expressos obtidos. Além da
análise computacional, foi realizado um levantamento bibliográfico para avaliar a expressão
gênica em genes experimentalmente já validados. Na análise funcional da união, obtivemos
genes envolvidos em processos biológicos como o metabolismo de ácidos graxos e corpos
cetônicos. O levantamento gene a gene (bottom-up) revelou que há genes envolvidos nos
processos de apoptose, ciclo celular, inflamação, sistema imunológico e estresse oxidativo.
As vias metabólicas enriquecidas estavam relacionadas com o metabolismo e síntese de
ácidos graxos, sinalização de insulina, metabolismo do piruvato, sinalização de AMPK e
de PPARs. Porém, devido a complexidade das vias o exato mecanismo que a KD exerce
ainda não pode ser bem compreendido. A análise de microarranjos apresentou genes mais
bem anotados e foi plenamente executada em servidores remotos. Os resultados parciais
desse trabalho foram publicados no CBEB 2020 como um artigo completo.