Durante o início do desenvolvimento embrionário, ocorre um importante processo de remodelação dos padrões de metilação de DNA encontrados no genoma nuclear do embrião. Essa dinâmica de metilação também ocorre com o DNA mitocondrial (DNAmt), porém de forma distinta. Enquanto no DNA nuclear (DNAn) ocorre uma diminuição dos níveis globais de metilação até o estágio de mórula com posterior metilação de novo, no DNAmt há um aumento inicial nos níveis de metilação, para posterior desmetilação. A S-adenosilmetionina (SAM) desempenha um papel crucial nesses processos como principal doadora de grupos metil, sendo a DNMT1 a enzima responsável pela adição desses grupos ao DNA. Recentemente, o sensor de S-adenosilmetionina (SAMTOR) foi identificado como um regulador upstream do complexo 1 do alvo mecanicista da rapamicina (mTORC1), modulando o influxo de metionina, aminoácido precursor da SAM. Além disso, o mTORC1 também regula a expressão da enzima DNMT1. Com base nesses mecanismos, este estudo teve como hipótese que o silenciamento do SAMTOR aumenta os níveis de SAM, consequentemente impactando o perfil de reprogramação da metilação do DNAn e DNAmt ao longo do desenvolvimento embrionário inicial, com aumento dos níveis de metilação no blastocisto. Para testar essa hipótese, embriões bovinos foram submetidos ao silenciamento do SAMTOR, através de RNA de interferência específico, e comparados a um grupo controle. As avaliações foram realizadas nos dias 2, 4 e 7 após a fertilização, utilizando técnicas de análise do metiloma do DNAmt por sequenciamento de nova geração (NGS). Os resultados mostraram que, quando comparados o grupo controle com o grupo cujo SAMTOR foi silenciado, as médias de metilação do DNAmt foram semelhantes nos contextos totais CG e CHH, mas apresentaram uma tendência a serem maiores no contexto CGH em embriões silenciados no segundo dia de cultivo. Quando comparados com relação ao dia de desenvolvimento, o grupo controle segue de acordo com o reportado na literatura, porém o grupo silenciado apresenta uma diminuição dos níveis de metilação ao decorrer do desenvolvimento. Esses achados sugerem que o SAMTOR desempenha um papel regulador na reprogramação epigenética do DNAmt durante o desenvolvimento embrionário inicial, destacando sua relevância no controle dos processos de metilação.