ANÁLISE DO REPETOMA DA ORQUÍDEA Epidendrum denticulatum Barb. Rodr.: UMA ABORDAGEM COMPARATIVA ENTRE AS POPULAÇÕES DOS BIOMAS MATA ATLÂNTICA E CERRADO
Epidendrum denticulatum Barb. Rodr. (Epidendroideae, Orchidaceae) é uma espécie de orquídea endêmica do Brasil que está distribuída entre os biomas de Mata Atlântica e Cerrado. Apesar de possuir número cromossômico constante (n=26/2n=52), populações de Cerrado apresentam tamanho de genoma (TG) maior em comparação com as de Mata Atlântica (1C = 2,91 pg e 1C = 2,63 pg, respectivamente). Neste trabalho, buscamos investigar a relação da variação do TG com a composição diferencial do repetoma entre os biomas por meio de análises in silico conduzidas via RepeatExplorer2 (RE2). O repetoma inclui sequências de elementos transponíveis (TEs) e de DNAs satélite (DNAsat), que no RE2 podem ser identificados em dados de sequenciamento em comparação com bancos de dados de sequências repetitivas conservadas entre plantas. Para executar nossa análise, inicialmente criamos um banco de dados personalizado com 208 DNAsat do gênero Epidendrum L. identificados em análises de caracterização do repetoma conduzidas via RE2 para 34 espécies, que apresentaram amplo compartilhamento de DNAsat entre diferentes linhagens do gênero. Este banco de dados foi utilizado como suporte para a caracterização do repetoma de 14 populações de E. denticulam no RE2 e, como resultado, nossa análise comparativa entre biomas indicou a expansão de dois clusters de DNAsat (CL1, CL3) e duas linhagens de TEs (LINEs e LTR/Ty3-gypsy/Athila) no Cerrado em comparação com a Mata Atlântica. Essa variação pode ter importantes implicações evolutivas, podendo indicar um processo de especiação incipiente em resposta às mudanças ambientais de populações de E. denticulatum que migraram da Mata Atlântica para o Cerrado logo após o período Quaternário.