Banca de DEFESA: MUHSEN HAMMOUD

Uma banca de DEFESA de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MUHSEN HAMMOUD
DATA : 25/04/2022
HORA: 14:00
LOCAL: https://conferenciaweb.rnp.br/webconf/joao-55
TÍTULO:

Abordagens Computacionais para Análise de Dados Estruturados em Sistemática Biológica e Biogeografia

PÁGINAS: 160
GRANDE ÁREA: Ciências Exatas e da Terra
ÁREA: Ciência da Computação
SUBÁREA: Metodologia e Técnicas da Computação
ESPECIALIDADE: Processamento Gráfico (Graphics)
RESUMO:

As ciências biológicas utilizam grafos acíclicos conectados - ou árvores - para apresentar as relações evolutivas e a história biogeográfica. A base das árvores pode ser evidências genéticas, moleculares, morfológicas, geológicas, comportamentais ou geográficas. Em estudos com grande quantidade de informação , especialmente quando se trata de muitos grupos biológicos diferentes ou de história biogeográfica complexa, o processamento manual de dados torna-se inviável e custoso (em termos de tempo e dinheiro). Além disso, os resultados podem apresentar muitos erros. Os biólogos evolucionistas já têm seus métodos para processar seus dados. No entanto, a aplicação desses métodos manualmente em grandes conjuntos de dados provou não ser prática, o que é um fardo significativo diante de uma maior compreensão dos dados disponíveis. Apesar da disponibilidade de algumas abordagens para processamento de dados estruturados, elas são desatualizadas ou difíceis de usar (como ferramentas computacionais de linha de comando). Esta tese se concentra em entender a própria base da filosofia da ciência da computação no contexto de problemas biológicos e evolutivos, para então, com base nesse entendimento, facilitar o trabalho dos biólogos evolutivos automatizando o fluxo de trabalho que seguem, em vez de alterá-lo. Aqui, apresentamos quatro abordagens computacionais, três das quais estão preocupadas com a construção de uma matriz MRP combinada usando árvores de entrada em formato de parênteses. Essas abordagens são denominadas: "Generating combined MRP-matrices", "Generating Topographic-Units MRP-matrix" e "Generating Combined Areagram MRP-matrix". Enquanto o quarto, denominado "interactive Phylogenetic trees Comparison (iPhyloC)",  utiliza a visualização de informações para facilitar a comparação de árvores filogenéticas. Nós encapsulamos todas as abordagens computacionais desta tese em frameworks web-based e de fácil utilização  disponíveis gratuitamente. Desenvolvemos as quatro abordagens em estreita colaboração com especialistas do domínio. Os resultados dos testes de todas as abordagens mostram que são confiáveis, fáceis de usar e fornecem resultados corretos. Eles de fato ajudam os biólogos evolutivos a se concentrarem em obter resultados a partir dos dados disponíveis, em vez de gastar tempo processando os dados.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - Interno ao Programa - 1672977 - JOAO PAULO GOIS
Membro Titular - Examinador(a) Interno ao Programa - 1722875 - DAVID CORREA MARTINS JUNIOR
Membro Titular - Examinador(a) Externo ao Programa - 1308531 - TIAGO FERNANDES CARRIJO
Membro Titular - Examinador(a) Externo à Instituição - CYNTHIA DE OLIVEIRA LAGE FERREIRA - USP
Membro Titular - Examinador(a) Externo à Instituição - FRANCISCO ELÓI SOARES DE ARAÚJO - UFMS
Membro Suplente - Examinador(a) Interno ao Programa - 1675615 - LUIZ CARLOS DA SILVA ROZANTE
Membro Suplente - Examinador(a) Externo ao Programa - 1834571 - OTTO MULLER PATRAO DE OLIVEIRA
Membro Suplente - Examinador(a) Externo ao Programa - 1676326 - CHARLES MORPHY DIAS DOS SANTOS
Membro Suplente - Examinador(a) Externo à Instituição - WALLACE CORREA DE OLIVEIRA CASACA - UNESP