Banca de DEFESA: LEONARDO ANDRADE CASTRO

Uma banca de DEFESA de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : LEONARDO ANDRADE CASTRO
DATA : 16/12/2021
HORA: 09:00
LOCAL: por participação remota em https://meet.google.com/fhe-zarb-dpq
TÍTULO:

ANÁLISE TOPOLÓGICA DE REDES MOLECULARES INTEGRADAS DE CO-EXPRESSÃO E INTERAÇÕES PROTEÍNA-PROTEÍNA NO TRANSTORNO DO ESPECTRO AUTISTA

PÁGINAS: 50
RESUMO:

O transtorno do espectro autista possui grande heterogeneidade fenotípica e genotípica, sendo caracterizada como uma doença complexa. A arquitetura genética desse transtorno é composta por variantes raras herdadas e de novo. Os genes impactados por essas variantes convergem em vias biológicas. A topologia das interações entre esses genes e com fenótipos a nível individual é pouco explorado. Investigamos se é possível agrupar pacientes a partir de suas topologias de redes biológicas integradas. Selecionamos subgrupos do TEA baseados em componentes de scores de exposição a fatores de risco ambiental e biológico e comparamos as topologias das subredes priorizadas. Os pacientes tiveram seus exomas sequenciados dos quais selecionamos variantes raras e variantes de novo, mapeamos as variantes no interatoma humano e priorizamos as interações baseando-se na topologia de cara gene e padrão de expressão do córtex pré-frontal. A partir dos genes e interações priorizados de cada paciente e da integração com dados de co-expressão através do método NERI, caracterizamos a topologia com 40 medidas topológicas locais e caracterizamos a topologia global com medidas da teoria da informação. O estudo das topologias de subredes em transtornos do desenvolvimento tem potencial para revelar caracteristicas emergentes úteis na estratificação de subgrupos de pacientes.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - Interno ao Programa - 1722875 - DAVID CORREA MARTINS JUNIOR
Membro Titular - Examinador(a) Interno ao Programa - 1994696 - SILVIA HONDA TAKADA
Membro Titular - Examinador(a) Externo à Instituição - VANESSA DE JESUS RODRIGUES DE PAULA - USP
Membro Suplente - Examinador(a) Interno ao Programa - 1676367 - ALEXANDRE HIROAKI KIHARA
Membro Suplente - Examinador(a) Externo à Instituição - HELDER TAKASHI IMOTO NAKAYA - USP