Los cursos de maestría y doctorado del programa de Biotecnología son reconocidos por la CAPES y tienen como objetivo formar profesionales cualificados para contribuir al desarrollo del área de Biotecnología del país.

Las investigaciones en el marco del programa involucran investigaciones de frontera en bioinformática, ingeniería de tejidos, nanomedicina, biofotónica, biotecnología de la reproducción, biotecnología vegetal, física médica y enzimas industriales. La misión principal del programa es formar recursos humanos capacitados para actuar en la enseñanza, en la investigación y principalmente en la generación de productos y procesos biotecnológicos, de modo a promover acercamiento entre el sector académico y productivo. El programa también tiene como objetivo estimular al estudiante a ejercitar actividades de gestión y de emprendedorismo en bionegocios a través del ofrecimiento de disciplinas relacionadas a la propiedad intelectual y transferencia de tecnología.